祝橋鎮(zhèn)現(xiàn)轄20個行政村、12個居委會、1個區(qū)級工業(yè)區(qū)：第一、第二、東港花苑、千匯一村、二村、三村、四村、祝和苑、祝安苑、朝陽、東海、鹽倉12個居委；機場、亭中、三八、金星、祝東、衛(wèi)民、星光、明星、祝西、紅三、新東、新如、薛洪、義泓、先進、星火、紅星、高永、果園、立新20個村（04年以前另瞎有永樂村、陸樓村）。

2003年，撤銷祝橋鎮(zhèn)、東海鎮(zhèn)、鹽倉鎮(zhèn)建制，設(shè)立新的祝橋鎮(zhèn)。

2004年5月，陸樓、永樂兩村整建制劃歸惠南鎮(zhèn)管轄。

2009年8月，隨著南匯浦東兩區(qū)合并，祝橋歸浦東新區(qū)管轄。

2012年，浦東新區(qū)對原川沙新鎮(zhèn)、祝橋鎮(zhèn)、六灶鎮(zhèn)行政區(qū)域進行調(diào)整，實行撤三建二，原川沙新鎮(zhèn)的江鎮(zhèn)社區(qū)和施灣社區(qū)劃入祝橋行政區(qū)域，原六灶鎮(zhèn)整體劃入川沙新鎮(zhèn)，撤銷六灶鎮(zhèn)建制，成立新的川沙新鎮(zhèn)和祝橋鎮(zhèn)。成為全國獨有的兩個副局級鄉(xiāng)鎮(zhèn)。

祝橋外來人口眾多，男女比例比較穩(wěn)定。鎮(zhèn)域人口12萬，其中常住人口7.5萬，來滬人員4.5萬。常住人口中，農(nóng)業(yè)人口26676人，居民48735人，農(nóng)居民比例接近1：2。

2000年3月，上海祝橋空港工業(yè)區(qū)經(jīng)原南匯縣人民政府批準(zhǔn)成立；2006年8月，經(jīng)國家發(fā)改委批準(zhǔn)，上海祝橋空港工業(yè)區(qū)與周邊三個產(chǎn)業(yè)區(qū)合并為上海浦東空港工業(yè)園區(qū)，成為上海市級工業(yè)區(qū)。2007年7月，原南匯區(qū)委批準(zhǔn)設(shè)立臨空經(jīng)濟功能區(qū)管理委員會，負責(zé)統(tǒng)籌協(xié)調(diào)臨空地區(qū)的開發(fā)建設(shè)工作。目前，祝橋全鎮(zhèn)產(chǎn)業(yè)規(guī)劃面積10平方公里，分為祝橋空港工業(yè)區(qū)、國家級空港綜合保稅區(qū)、祝橋空港倉儲物流園區(qū)等三個板塊，其中祝橋空港工業(yè)區(qū)規(guī)劃面積為5.1平方公里，空港綜合保稅區(qū)為0.54平方公里，祝橋空港倉儲物流園區(qū)為4.31平方公里。目前，鎮(zhèn)內(nèi)共有內(nèi)外資企業(yè)1950余家。其中，DHL、UPS、飛利浦、漢高、日本森松、日本歐利生、新加坡赫比、重礦連鑄、市一電機等多個國家和地區(qū)的著名企業(yè)，相繼在祝橋投資落戶。

祝橋高級中學(xué)、祝橋中心小學(xué)、上海實驗學(xué)校附屬光明學(xué)校等教育機構(gòu)。